Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vmn1r196Q5SVD5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.1 ms