Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms