Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r223Q5SSA0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r223Q5SSA0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms