Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZJ0

Drosha, Ribonuclease 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DroshaQ5HZJ0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DroshaQ5HZJ0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
DroshaQ5HZJ0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DroshaQ5HZJ0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
DroshaQ5HZJ0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DroshaQ5HZJ0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DroshaQ5HZJ0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DroshaQ5HZJ0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms