Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG8

Uncharacterized protein C1orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5EBG8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q5EBG8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q5EBG8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q5EBG8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q5EBG8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q5EBG8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q5EBG8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q5EBG8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q5EBG8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q5EBG8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q5EBG8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q5EBG8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q5EBG8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Q5EBG8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q5EBG8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q5EBG8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q5EBG8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q5EBG8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q5EBG8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q5EBG8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q5EBG8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q5EBG8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q5EBG8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q5EBG8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q5EBG8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q5EBG8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q5EBG8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q5EBG8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q5EBG8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q5EBG8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q5EBG8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q5EBG8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q5EBG8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q5EBG8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q5EBG8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q5EBG8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q5EBG8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q5EBG8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q5EBG8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q5EBG8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q5EBG8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms