Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmub2Q3V209 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms