Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms