Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 263.2 ms