Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI43

Babam1, BRISC and BRCA1-A complex member 1, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Babam1Q3UI43 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Babam1Q3UI43 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Babam1Q3UI43 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Babam1Q3UI43 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Babam1Q3UI43 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Babam1Q3UI43 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Babam1Q3UI43 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Babam1Q3UI43 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Babam1Q3UI43 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Babam1Q3UI43 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Babam1Q3UI43 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Babam1Q3UI43 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Babam1Q3UI43 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Babam1Q3UI43 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Babam1Q3UI43 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Babam1Q3UI43 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Babam1Q3UI43 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Babam1Q3UI43 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Babam1Q3UI43 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Babam1Q3UI43 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Babam1Q3UI43 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Babam1Q3UI43 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Babam1Q3UI43 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Babam1Q3UI43 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Babam1Q3UI43 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Babam1Q3UI43 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms