Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vars2Q3U2A8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms