Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3KNL4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3KNL4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3KNL4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3KNL4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3KNL4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3KNL4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3KNL4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3KNL4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3KNL4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3KNL4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3KNL4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3KNL4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3KNL4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3KNL4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3KNL4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms