Protein–RNA interactions for Protein: Q1HDU4

Arhgap9, ArhGAP9, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap9Q1HDU4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arhgap9Q1HDU4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arhgap9Q1HDU4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms