Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KARSQ15046 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KARSQ15046 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KARSQ15046 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KARSQ15046 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KARSQ15046 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KARSQ15046 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KARSQ15046 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KARSQ15046 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KARSQ15046 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KARSQ15046 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KARSQ15046 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KARSQ15046 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KARSQ15046 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KARSQ15046 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KARSQ15046 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KARSQ15046 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KARSQ15046 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KARSQ15046 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KARSQ15046 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KARSQ15046 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KARSQ15046 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KARSQ15046 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KARSQ15046 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KARSQ15046 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KARSQ15046 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KARSQ15046 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KARSQ15046 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KARSQ15046 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KARSQ15046 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KARSQ15046 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KARSQ15046 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KARSQ15046 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KARSQ15046 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KARSQ15046 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KARSQ15046 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KARSQ15046 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KARSQ15046 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KARSQ15046 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KARSQ15046 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KARSQ15046 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KARSQ15046 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KARSQ15046 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KARSQ15046 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KARSQ15046 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KARSQ15046 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KARSQ15046 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KARSQ15046 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KARSQ15046 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KARSQ15046 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KARSQ15046 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KARSQ15046 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KARSQ15046 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KARSQ15046 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KARSQ15046 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KARSQ15046 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KARSQ15046 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KARSQ15046 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KARSQ15046 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KARSQ15046 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KARSQ15046 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KARSQ15046 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KARSQ15046 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KARSQ15046 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KARSQ15046 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KARSQ15046 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KARSQ15046 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KARSQ15046 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KARSQ15046 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KARSQ15046 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KARSQ15046 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KARSQ15046 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KARSQ15046 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KARSQ15046 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KARSQ15046 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KARSQ15046 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KARSQ15046 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KARSQ15046 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KARSQ15046 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KARSQ15046 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KARSQ15046 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KARSQ15046 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KARSQ15046 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KARSQ15046 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KARSQ15046 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KARSQ15046 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KARSQ15046 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KARSQ15046 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KARSQ15046 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KARSQ15046 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KARSQ15046 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KARSQ15046 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KARSQ15046 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KARSQ15046 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KARSQ15046 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KARSQ15046 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KARSQ15046 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KARSQ15046 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KARSQ15046 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KARSQ15046 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
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