Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DDX39BQ13838 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DDX39BQ13838 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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