Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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