Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms