Protein–RNA interactions for Protein: Q05738

Sry, Sex-determining region Y protein, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SryQ05738 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SryQ05738 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SryQ05738 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SryQ05738 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SryQ05738 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SryQ05738 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SryQ05738 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SryQ05738 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SryQ05738 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SryQ05738 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SryQ05738 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SryQ05738 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SryQ05738 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SryQ05738 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SryQ05738 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SryQ05738 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SryQ05738 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SryQ05738 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SryQ05738 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SryQ05738 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SryQ05738 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SryQ05738 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SryQ05738 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SryQ05738 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SryQ05738 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SryQ05738 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SryQ05738 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SryQ05738 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SryQ05738 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SryQ05738 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SryQ05738 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SryQ05738 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SryQ05738 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SryQ05738 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SryQ05738 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SryQ05738 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SryQ05738 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SryQ05738 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SryQ05738 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SryQ05738 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SryQ05738 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SryQ05738 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SryQ05738 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SryQ05738 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SryQ05738 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SryQ05738 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SryQ05738 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SryQ05738 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SryQ05738 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SryQ05738 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SryQ05738 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SryQ05738 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SryQ05738 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SryQ05738 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SryQ05738 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SryQ05738 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SryQ05738 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SryQ05738 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SryQ05738 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SryQ05738 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SryQ05738 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SryQ05738 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SryQ05738 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SryQ05738 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SryQ05738 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SryQ05738 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SryQ05738 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SryQ05738 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SryQ05738 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SryQ05738 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SryQ05738 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SryQ05738 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SryQ05738 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SryQ05738 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SryQ05738 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SryQ05738 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SryQ05738 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SryQ05738 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SryQ05738 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SryQ05738 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SryQ05738 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SryQ05738 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SryQ05738 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SryQ05738 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SryQ05738 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SryQ05738 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SryQ05738 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SryQ05738 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SryQ05738 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SryQ05738 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SryQ05738 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SryQ05738 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SryQ05738 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SryQ05738 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SryQ05738 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SryQ05738 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SryQ05738 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SryQ05738 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SryQ05738 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SryQ05738 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.2 ms