Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms