Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top1Q04750 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top1Q04750 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Top1Q04750 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Top1Q04750 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Top1Q04750 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Top1Q04750 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Top1Q04750 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Top1Q04750 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1Q04750 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1Q04750 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1Q04750 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top1Q04750 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top1Q04750 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms