Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms