Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms