Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx2P81066 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx2P81066 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx2P81066 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx2P81066 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx2P81066 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms