Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms