Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab1AP62821 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms