Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms