Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf13P61216 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf13P61216 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf13P61216 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf13P61216 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf13P61216 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf13P61216 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf13P61216 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf13P61216 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf13P61216 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf13P61216 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf13P61216 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf13P61216 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf13P61216 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf13P61216 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf13P61216 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf13P61216 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms