Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NcstnP57716 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NcstnP57716 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NcstnP57716 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NcstnP57716 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NcstnP57716 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms