Protein–RNA interactions for Protein: P56942

Pmch, Pro-MCH, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmchP56942 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmchP56942 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmchP56942 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmchP56942 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmchP56942 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
PmchP56942 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmchP56942 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmchP56942 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmchP56942 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmchP56942 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmchP56942 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmchP56942 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmchP56942 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmchP56942 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PmchP56942 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmchP56942 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PmchP56942 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmchP56942 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmchP56942 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmchP56942 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmchP56942 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmchP56942 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmchP56942 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmchP56942 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmchP56942 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmchP56942 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmchP56942 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmchP56942 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmchP56942 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmchP56942 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmchP56942 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmchP56942 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmchP56942 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmchP56942 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmchP56942 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmchP56942 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmchP56942 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PmchP56942 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmchP56942 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmchP56942 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmchP56942 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmchP56942 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmchP56942 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmchP56942 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmchP56942 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmchP56942 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmchP56942 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmchP56942 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmchP56942 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmchP56942 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmchP56942 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmchP56942 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmchP56942 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmchP56942 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmchP56942 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmchP56942 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmchP56942 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmchP56942 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmchP56942 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmchP56942 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmchP56942 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmchP56942 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PmchP56942 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmchP56942 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmchP56942 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmchP56942 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmchP56942 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmchP56942 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmchP56942 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmchP56942 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmchP56942 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmchP56942 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmchP56942 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmchP56942 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmchP56942 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmchP56942 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmchP56942 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmchP56942 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmchP56942 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmchP56942 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmchP56942 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmchP56942 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmchP56942 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmchP56942 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmchP56942 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmchP56942 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmchP56942 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmchP56942 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmchP56942 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmchP56942 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmchP56942 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmchP56942 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmchP56942 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmchP56942 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmchP56942 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmchP56942 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmchP56942 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmchP56942 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmchP56942 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmchP56942 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms