Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CckbrP56481 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CckbrP56481 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CckbrP56481 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CckbrP56481 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CckbrP56481 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CckbrP56481 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CckbrP56481 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CckbrP56481 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CckbrP56481 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CckbrP56481 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CckbrP56481 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms