Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CartptP56388 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CartptP56388 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CartptP56388 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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CartptP56388 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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CartptP56388 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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CartptP56388 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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CartptP56388 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CartptP56388 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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CartptP56388 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CartptP56388 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CartptP56388 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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CartptP56388 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CartptP56388 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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CartptP56388 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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CartptP56388 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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CartptP56388 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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CartptP56388 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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CartptP56388 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CartptP56388 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CartptP56388 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CartptP56388 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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CartptP56388 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms