Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab4aP56371 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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