Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pex2P55098 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pex2P55098 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pex2P55098 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pex2P55098 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pex2P55098 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pex2P55098 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pex2P55098 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pex2P55098 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pex2P55098 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pex2P55098 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pex2P55098 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms