Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fdft1P53798 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fdft1P53798 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms