Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtgfrP43117 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 702.5 ms