Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TtlP38585 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TtlP38585 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TtlP38585 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TtlP38585 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TtlP38585 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TtlP38585 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TtlP38585 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TtlP38585 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TtlP38585 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TtlP38585 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TtlP38585 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TtlP38585 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TtlP38585 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TtlP38585 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TtlP38585 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TtlP38585 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TtlP38585 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TtlP38585 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TtlP38585 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TtlP38585 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TtlP38585 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TtlP38585 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TtlP38585 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TtlP38585 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TtlP38585 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TtlP38585 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TtlP38585 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TtlP38585 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TtlP38585 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TtlP38585 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TtlP38585 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TtlP38585 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TtlP38585 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TtlP38585 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TtlP38585 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TtlP38585 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TtlP38585 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TtlP38585 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TtlP38585 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TtlP38585 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TtlP38585 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TtlP38585 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TtlP38585 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TtlP38585 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TtlP38585 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TtlP38585 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TtlP38585 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TtlP38585 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TtlP38585 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TtlP38585 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TtlP38585 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TtlP38585 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TtlP38585 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TtlP38585 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TtlP38585 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TtlP38585 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TtlP38585 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TtlP38585 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TtlP38585 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TtlP38585 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TtlP38585 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TtlP38585 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TtlP38585 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TtlP38585 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TtlP38585 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TtlP38585 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TtlP38585 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TtlP38585 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TtlP38585 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TtlP38585 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TtlP38585 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TtlP38585 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TtlP38585 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TtlP38585 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TtlP38585 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TtlP38585 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TtlP38585 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TtlP38585 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TtlP38585 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TtlP38585 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TtlP38585 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TtlP38585 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TtlP38585 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TtlP38585 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TtlP38585 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TtlP38585 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TtlP38585 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TtlP38585 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TtlP38585 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TtlP38585 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TtlP38585 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TtlP38585 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TtlP38585 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TtlP38585 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TtlP38585 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TtlP38585 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TtlP38585 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TtlP38585 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtlP38585 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms