Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFC1P35251 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RFC1P35251 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFC1P35251 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFC1P35251 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFC1P35251 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFC1P35251 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFC1P35251 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFC1P35251 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFC1P35251 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFC1P35251 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFC1P35251 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RFC1P35251 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFC1P35251 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFC1P35251 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFC1P35251 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RFC1P35251 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFC1P35251 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFC1P35251 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RFC1P35251 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFC1P35251 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFC1P35251 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFC1P35251 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFC1P35251 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFC1P35251 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFC1P35251 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFC1P35251 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFC1P35251 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFC1P35251 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFC1P35251 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFC1P35251 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFC1P35251 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFC1P35251 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFC1P35251 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFC1P35251 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFC1P35251 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFC1P35251 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFC1P35251 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFC1P35251 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFC1P35251 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFC1P35251 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFC1P35251 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFC1P35251 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFC1P35251 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFC1P35251 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFC1P35251 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFC1P35251 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFC1P35251 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RFC1P35251 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFC1P35251 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFC1P35251 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFC1P35251 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFC1P35251 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFC1P35251 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFC1P35251 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFC1P35251 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFC1P35251 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFC1P35251 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFC1P35251 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFC1P35251 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFC1P35251 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFC1P35251 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFC1P35251 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFC1P35251 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFC1P35251 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFC1P35251 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFC1P35251 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFC1P35251 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFC1P35251 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFC1P35251 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFC1P35251 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RFC1P35251 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFC1P35251 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFC1P35251 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFC1P35251 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFC1P35251 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFC1P35251 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFC1P35251 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFC1P35251 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFC1P35251 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFC1P35251 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFC1P35251 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFC1P35251 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFC1P35251 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RFC1P35251 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFC1P35251 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFC1P35251 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFC1P35251 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RFC1P35251 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFC1P35251 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFC1P35251 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFC1P35251 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFC1P35251 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFC1P35251 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFC1P35251 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFC1P35251 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFC1P35251 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFC1P35251 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFC1P35251 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFC1P35251 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms