Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stfa3P35173 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Stfa3P35173 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Stfa3P35173 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stfa3P35173 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stfa3P35173 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stfa3P35173 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stfa3P35173 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stfa3P35173 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Stfa3P35173 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stfa3P35173 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stfa3P35173 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stfa3P35173 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stfa3P35173 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Stfa3P35173 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stfa3P35173 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Stfa3P35173 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms