Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms