Protein–RNA interactions for Protein: P32848

Pvalb, Parvalbumin alpha, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PvalbP32848 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PvalbP32848 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PvalbP32848 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PvalbP32848 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PvalbP32848 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PvalbP32848 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PvalbP32848 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PvalbP32848 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PvalbP32848 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PvalbP32848 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms