Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd28P31041 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd28P31041 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd28P31041 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd28P31041 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd28P31041 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd28P31041 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd28P31041 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms