Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VtnP29788 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VtnP29788 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VtnP29788 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VtnP29788 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VtnP29788 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VtnP29788 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VtnP29788 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VtnP29788 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VtnP29788 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VtnP29788 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VtnP29788 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VtnP29788 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VtnP29788 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VtnP29788 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VtnP29788 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VtnP29788 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VtnP29788 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VtnP29788 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VtnP29788 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VtnP29788 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VtnP29788 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VtnP29788 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VtnP29788 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VtnP29788 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VtnP29788 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VtnP29788 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VtnP29788 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VtnP29788 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VtnP29788 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VtnP29788 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VtnP29788 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VtnP29788 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VtnP29788 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VtnP29788 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VtnP29788 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VtnP29788 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VtnP29788 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VtnP29788 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VtnP29788 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VtnP29788 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VtnP29788 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VtnP29788 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VtnP29788 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VtnP29788 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VtnP29788 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VtnP29788 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VtnP29788 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VtnP29788 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VtnP29788 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VtnP29788 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VtnP29788 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VtnP29788 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VtnP29788 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VtnP29788 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VtnP29788 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VtnP29788 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VtnP29788 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VtnP29788 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VtnP29788 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VtnP29788 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VtnP29788 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VtnP29788 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VtnP29788 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VtnP29788 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VtnP29788 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VtnP29788 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VtnP29788 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VtnP29788 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VtnP29788 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VtnP29788 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VtnP29788 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VtnP29788 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VtnP29788 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VtnP29788 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VtnP29788 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VtnP29788 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VtnP29788 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VtnP29788 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VtnP29788 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VtnP29788 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VtnP29788 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VtnP29788 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VtnP29788 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VtnP29788 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VtnP29788 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VtnP29788 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VtnP29788 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VtnP29788 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VtnP29788 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VtnP29788 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VtnP29788 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VtnP29788 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VtnP29788 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VtnP29788 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VtnP29788 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VtnP29788 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
VtnP29788 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VtnP29788 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VtnP29788 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms