Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aco1P28271 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aco1P28271 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Aco1P28271 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aco1P28271 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aco1P28271 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aco1P28271 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aco1P28271 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aco1P28271 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aco1P28271 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aco1P28271 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aco1P28271 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aco1P28271 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms