Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMA5P28066 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMA5P28066 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMA5P28066 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMA5P28066 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMA5P28066 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMA5P28066 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMA5P28066 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMA5P28066 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMA5P28066 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMA5P28066 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMA5P28066 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMA5P28066 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMA5P28066 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMA5P28066 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMA5P28066 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMA5P28066 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMA5P28066 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMA5P28066 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMA5P28066 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMA5P28066 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMA5P28066 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMA5P28066 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMA5P28066 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMA5P28066 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMA5P28066 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMA5P28066 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms