Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnnc1P19123 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms