Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc1P18828 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc1P18828 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms