Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl2P10889 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl2P10889 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl2P10889 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl2P10889 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl2P10889 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl2P10889 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl2P10889 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl2P10889 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl2P10889 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl2P10889 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl2P10889 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl2P10889 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl2P10889 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl2P10889 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl2P10889 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl2P10889 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl2P10889 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl2P10889 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms