Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf3P09920 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf3P09920 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf3P09920 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf3P09920 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csf3P09920 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Csf3P09920 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf3P09920 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3P09920 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3P09920 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3P09920 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csf3P09920 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms