Protein–RNA interactions for Protein: P07350

Ifna6, Interferon alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna6P07350 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ifna6P07350 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms