Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06323 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06323 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06323 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06323 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06323 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06323 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06323 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P06323 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P06323 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06323 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06323 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06323 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06323 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06323 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06323 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06323 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06323 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06323 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06323 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06323 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06323 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06323 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06323 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06323 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06323 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06323 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06323 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06323 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06323 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06323 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06323 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P06323 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06323 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P06323 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06323 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06323 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06323 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06323 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06323 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06323 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06323 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06323 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06323 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06323 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06323 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06323 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06323 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06323 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06323 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06323 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06323 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06323 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06323 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06323 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06323 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P06323 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06323 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06323 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06323 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06323 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06323 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06323 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06323 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06323 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06323 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06323 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06323 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06323 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06323 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06323 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06323 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06323 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06323 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06323 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06323 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06323 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06323 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P06323 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P06323 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P06323 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06323 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06323 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06323 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06323 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06323 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06323 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06323 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06323 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06323 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06323 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06323 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06323 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06323 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06323 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06323 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06323 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06323 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06323 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06323 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms