Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CntfrO88507 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfrO88507 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfrO88507 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfrO88507 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfrO88507 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfrO88507 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfrO88507 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfrO88507 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfrO88507 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfrO88507 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms